Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Z3

GTPBP8, GTP-binding protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP8Q8N3Z3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTPBP8Q8N3Z3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP8Q8N3Z3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTPBP8Q8N3Z3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTPBP8Q8N3Z3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms