Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2K1

UBE2J2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2Q8N2K1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2J2Q8N2K1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2J2Q8N2K1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2J2Q8N2K1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms