Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPAS3Q8IXF0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPAS3Q8IXF0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPAS3Q8IXF0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NPAS3Q8IXF0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NPAS3Q8IXF0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms