Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX18

DHX40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX40Q8IX18 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX40Q8IX18 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX40Q8IX18 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX40Q8IX18 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DHX40Q8IX18 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DHX40Q8IX18 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX40Q8IX18 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX40Q8IX18 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.9 ms