Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC103Q8IW40 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC103Q8IW40 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC103Q8IW40 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC103Q8IW40 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms