Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM139Q8IV31 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM139Q8IV31 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM139Q8IV31 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM139Q8IV31 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms