Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC29A4Q7RTT9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC29A4Q7RTT9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC29A4Q7RTT9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms