Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTF1AQ7RTS3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PTF1AQ7RTS3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTF1AQ7RTS3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTF1AQ7RTS3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTF1AQ7RTS3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms