Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MUC6Q6W4X9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MUC6Q6W4X9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MUC6Q6W4X9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms