Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN1Q6UXK5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRN1Q6UXK5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRN1Q6UXK5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRN1Q6UXK5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRN1Q6UXK5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms