Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMCO3Q6UWJ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMCO3Q6UWJ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMCO3Q6UWJ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMCO3Q6UWJ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
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