Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C16orf54Q6UWD8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C16orf54Q6UWD8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C16orf54Q6UWD8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms