Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP4Q6PIL6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNIP4Q6PIL6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP4Q6PIL6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNIP4Q6PIL6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP4Q6PIL6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP4Q6PIL6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP4Q6PIL6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP4Q6PIL6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP4Q6PIL6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP4Q6PIL6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP4Q6PIL6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNIP4Q6PIL6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KCNIP4Q6PIL6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNIP4Q6PIL6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNIP4Q6PIL6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms