Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM88Q6PEY1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM88Q6PEY1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM88Q6PEY1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM88Q6PEY1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms