Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMBOX1Q6NT76 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMBOX1Q6NT76 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMBOX1Q6NT76 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HMBOX1Q6NT76 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms