Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABLIM2Q6H8Q1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABLIM2Q6H8Q1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABLIM2Q6H8Q1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABLIM2Q6H8Q1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABLIM2Q6H8Q1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABLIM2Q6H8Q1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABLIM2Q6H8Q1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABLIM2Q6H8Q1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABLIM2Q6H8Q1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABLIM2Q6H8Q1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABLIM2Q6H8Q1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABLIM2Q6H8Q1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms