Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
REP15Q6BDI9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
REP15Q6BDI9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
REP15Q6BDI9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
REP15Q6BDI9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms