Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DUPD1Q68J44 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DUPD1Q68J44 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUPD1Q68J44 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUPD1Q68J44 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUPD1Q68J44 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms