Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMBRD2Q68DH5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LMBRD2Q68DH5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LMBRD2Q68DH5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMBRD2Q68DH5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMBRD2Q68DH5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMBRD2Q68DH5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBRD2Q68DH5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBRD2Q68DH5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMBRD2Q68DH5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD2Q68DH5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD2Q68DH5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD2Q68DH5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD2Q68DH5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD2Q68DH5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD2Q68DH5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD2Q68DH5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMBRD2Q68DH5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms