Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACHD1Q5VU97 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms