Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF38BQ5VTL8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF38BQ5VTL8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF38BQ5VTL8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms