Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYT6Q5T7P8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT6Q5T7P8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT6Q5T7P8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT6Q5T7P8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT6Q5T7P8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT6Q5T7P8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT6Q5T7P8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT6Q5T7P8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT6Q5T7P8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT6Q5T7P8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT6Q5T7P8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT6Q5T7P8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT6Q5T7P8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT6Q5T7P8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT6Q5T7P8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT6Q5T7P8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms