Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SLC27A3Q5K4L6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SLC27A3Q5K4L6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SLC27A3Q5K4L6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SLC27A3Q5K4L6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SLC27A3Q5K4L6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SLC27A3Q5K4L6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SLC27A3Q5K4L6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SLC27A3Q5K4L6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SLC27A3Q5K4L6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SLC27A3Q5K4L6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms