Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIN3Q5JUX0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPIN3Q5JUX0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SPIN3Q5JUX0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPIN3Q5JUX0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms