Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C4orf46Q504U0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C4orf46Q504U0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C4orf46Q504U0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C4orf46Q504U0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms