Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED5Q49AG3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBED5Q49AG3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED5Q49AG3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ZBED5Q49AG3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZBED5Q49AG3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms