Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI67

KRTAP6-3, Keratin-associated protein 6-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP6-3Q3LI67 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
KRTAP6-3Q3LI67 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
KRTAP6-3Q3LI67 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms