Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FXNQ16595 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FXNQ16595 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FXNQ16595 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FXNQ16595 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FXNQ16595 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FXNQ16595 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FXNQ16595 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FXNQ16595 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FXNQ16595 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FXNQ16595 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FXNQ16595 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FXNQ16595 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FXNQ16595 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FXNQ16595 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FXNQ16595 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FXNQ16595 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FXNQ16595 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FXNQ16595 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FXNQ16595 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FXNQ16595 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FXNQ16595 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FXNQ16595 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FXNQ16595 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FXNQ16595 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FXNQ16595 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FXNQ16595 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FXNQ16595 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FXNQ16595 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FXNQ16595 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FXNQ16595 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FXNQ16595 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FXNQ16595 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FXNQ16595 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FXNQ16595 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FXNQ16595 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FXNQ16595 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FXNQ16595 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FXNQ16595 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FXNQ16595 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FXNQ16595 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FXNQ16595 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FXNQ16595 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FXNQ16595 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FXNQ16595 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FXNQ16595 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FXNQ16595 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FXNQ16595 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FXNQ16595 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FXNQ16595 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FXNQ16595 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FXNQ16595 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FXNQ16595 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FXNQ16595 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FXNQ16595 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FXNQ16595 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FXNQ16595 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FXNQ16595 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FXNQ16595 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FXNQ16595 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FXNQ16595 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FXNQ16595 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FXNQ16595 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FXNQ16595 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FXNQ16595 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FXNQ16595 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FXNQ16595 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FXNQ16595 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FXNQ16595 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FXNQ16595 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FXNQ16595 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FXNQ16595 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FXNQ16595 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FXNQ16595 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FXNQ16595 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FXNQ16595 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FXNQ16595 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FXNQ16595 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FXNQ16595 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FXNQ16595 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FXNQ16595 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FXNQ16595 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FXNQ16595 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FXNQ16595 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FXNQ16595 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FXNQ16595 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FXNQ16595 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FXNQ16595 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FXNQ16595 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FXNQ16595 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FXNQ16595 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FXNQ16595 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FXNQ16595 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FXNQ16595 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FXNQ16595 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FXNQ16595 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FXNQ16595 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FXNQ16595 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FXNQ16595 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FXNQ16595 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
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