Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERPUD1Q15011 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERPUD1Q15011 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HERPUD1Q15011 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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