Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL19A1Q14993 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL19A1Q14993 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
COL19A1Q14993 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL19A1Q14993 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL19A1Q14993 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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