Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CHD4Q14839 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHD4Q14839 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
CHD4Q14839 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CHD4Q14839 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CHD4Q14839 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
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