Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX6Q13608 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX6Q13608 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX6Q13608 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX6Q13608 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX6Q13608 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
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