Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX6Q13608 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX6Q13608 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PEX6Q13608 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX6Q13608 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PEX6Q13608 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PEX6Q13608 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX6Q13608 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PEX6Q13608 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PEX6Q13608 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms