Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRR1Q13601 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRR1Q13601 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRR1Q13601 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRR1Q13601 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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