Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB3Q13509 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBB3Q13509 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB3Q13509 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB3Q13509 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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