Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTM1Q13496 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MTM1Q13496 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTM1Q13496 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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