Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAA1Q13131 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKAA1Q13131 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKAA1Q13131 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKAA1Q13131 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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