Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYO1EQ12965 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYO1EQ12965 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MYO1EQ12965 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYO1EQ12965 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYO1EQ12965 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYO1EQ12965 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYO1EQ12965 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYO1EQ12965 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1EQ12965 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1EQ12965 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1EQ12965 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYO1EQ12965 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYO1EQ12965 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms