Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN13Q12923 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN13Q12923 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPN13Q12923 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN13Q12923 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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