Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIPAL4Q0D2K0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIPAL4Q0D2K0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NIPAL4Q0D2K0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NIPAL4Q0D2K0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NIPAL4Q0D2K0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NIPAL4Q0D2K0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NIPAL4Q0D2K0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms