Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN1BQ07699 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN1BQ07699 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN1BQ07699 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN1BQ07699 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN1BQ07699 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN1BQ07699 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN1BQ07699 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN1BQ07699 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN1BQ07699 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN1BQ07699 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN1BQ07699 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN1BQ07699 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCN1BQ07699 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms