Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 RPRD1A-211ENST00000592674 566 ntTSL 418.5■□□□□ 0.556e-12■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 RPTOR-208ENST00000574767 2461 ntTSL 218.25■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 FOXK2-211ENST00000575578 571 ntTSL 217.91■□□□□ 0.466e-12■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.144e-8■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 AC015688.5-201ENST00000584605 603 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -06e-12■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 FHIT-204ENST00000468189 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 FHIT-206ENST00000488467 601 ntTSL 313.84□□□□□ -0.194e-8■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 212.8□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 FHIT-207ENST00000490952 1720 ntTSL 1 (best)12.03□□□□□ -0.484e-8■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 AC015688.5-202ENST00000579290 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.87□□□□□ -0.516e-12■■■■■ 42.2
FMR1Q06787 NLRP1-213ENST00000576905 555 ntTSL 415.37■□□□□ 0.054e-30■■■■■ 42
FMR1Q06787 NLRP1-209ENST00000572143 578 ntTSL 413.9□□□□□ -0.184e-30■■■■■ 42
FMR1Q06787 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.822e-7■■■■■ 42
FMR1Q06787 FLNA-213ENST00000466325 828 ntTSL 218.36■□□□□ 0.531e-19■■■■■ 41.8
FMR1Q06787 PTPN23-205ENST00000495653 676 ntTSL 217.41■□□□□ 0.386e-11■■■■■ 41.8
FMR1Q06787 ISYNA1-212ENST00000583309 371 ntTSL 213.73□□□□□ -0.216e-11■■■■■ 41.8
FMR1Q06787 ISYNA1-207ENST00000581672 793 ntTSL 211.62□□□□□ -0.556e-11■■■■■ 41.8
FMR1Q06787 TOP2A-204ENST00000578412 882 ntTSL 26.48□□□□□ -1.376e-11■■■■■ 41.8
FMR1Q06787 RBMX-206ENST00000561733 837 ntTSL 313.6□□□□□ -0.231e-22■■■■■ 41.7
FMR1Q06787 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.411e-22■■■■■ 41.7
FMR1Q06787 PPP6R3-217ENST00000529344 603 ntTSL 419.69■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 41.7
FMR1Q06787 PPP6R3-215ENST00000528635 538 ntTSL 419.69■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 41.7
FMR1Q06787 PPP6R3-220ENST00000530427 560 ntTSL 513.34□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 41.7
FMR1Q06787 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 41.7
FMR1Q06787 PPP6R3-219ENST00000529907 826 ntTSL 512.37□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 41.7
FMR1Q06787 PPP6R3-224ENST00000533127 551 ntTSL 412.37□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 41.7
FMR1Q06787 PPP6R3-226ENST00000534534 2968 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 41.7
FMR1Q06787 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 41.7
FMR1Q06787 PRKDC-203ENST00000432581 583 ntTSL 219.42■□□□□ 0.72e-14■■■■■ 41.7
FMR1Q06787 BAZ2A-213ENST00000551759 833 ntTSL 513.48□□□□□ -0.253e-9■■■■■ 41.5
FMR1Q06787 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 41.5
FMR1Q06787 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 41.5
FMR1Q06787 RPS6KC1-204ENST00000490299 5154 ntTSL 1 (best)3.89□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 41.5
FMR1Q06787 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.757e-10■■■■■ 41.3
FMR1Q06787 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.397e-10■■■■■ 41.3
FMR1Q06787 PFKFB3-218ENST00000639949 587 ntTSL 410.91□□□□□ -0.667e-10■■■■■ 41.3
FMR1Q06787 FAM49B-221ENST00000522361 367 ntTSL 423.94■■□□□ 1.421e-7■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FAM49B-209ENST00000518879 820 ntTSL 523.82■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FAM49B-205ENST00000518167 421 ntTSL 523.79■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FAM49B-219ENST00000521223 587 ntTSL 423.63■■□□□ 1.371e-7■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FAM49B-210ENST00000519020 573 ntTSL 520.12■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FAM49B-206ENST00000518283 574 ntTSL 411.32□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FAM49B-228ENST00000523993 581 ntTSL 37.64□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FAM49B-222ENST00000522702 544 ntTSL 46.2□□□□□ -1.421e-7■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.61e-7■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FAM49B-225ENST00000523288 4552 ntTSL 24.08□□□□□ -1.761e-7■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.81e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.81e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.741e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.651e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.721e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.711e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 WWOX-213ENST00000566662 571 ntTSL 419.33■□□□□ 0.681e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.581e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.281e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.21e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 SPIDR-214ENST00000521550 1849 ntTSL 216.01■□□□□ 0.151e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.041e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 GABRE-202ENST00000417300 619 ntTSL 214.47□□□□□ -0.091e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 SPIDR-212ENST00000519661 1035 ntTSL 214.11□□□□□ -0.151e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FGF13-206ENST00000448673 652 ntTSL 513.87□□□□□ -0.191e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 SPIDR-217ENST00000522117 2745 ntTSL 213.45□□□□□ -0.261e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.341e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 SPIDR-211ENST00000519401 2090 ntTSL 212.56□□□□□ -0.41e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 SPIDR-222ENST00000524006 970 ntTSL 512.09□□□□□ -0.471e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 SPIDR-225ENST00000524141 2761 ntTSL 211.71□□□□□ -0.541e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.551e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 SPIDR-224ENST00000524126 2614 ntTSL 1 (best)11.52□□□□□ -0.571e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.571e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 FGF13-205ENST00000441825 1625 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.621e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 GABRE-211ENST00000491339 2072 ntTSL 210.86□□□□□ -0.671e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 SPIDR-223ENST00000524033 1023 ntTSL 29.18□□□□□ -0.941e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 SPIDR-213ENST00000521214 3577 ntTSL 29.02□□□□□ -0.971e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.971e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.171e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 WWOX-208ENST00000562639 595 ntTSL 45.76□□□□□ -1.491e-11■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 214.38□□□□□ -0.111e-9■■■■■ 41.2
FMR1Q06787 TM2D1-211ENST00000496465 577 ntTSL 223.22■■□□□ 1.318e-7■■■■■ 41
FMR1Q06787 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.098e-7■■■■■ 41
FMR1Q06787 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.098e-7■■■■■ 41
FMR1Q06787 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.098e-7■■■■■ 41
FMR1Q06787 TM2D1-208ENST00000488206 921 ntTSL 518.63■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 41
FMR1Q06787 TM2D1-203ENST00000371178 1056 ntTSL 517.88■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 41
FMR1Q06787 TM2D1-210ENST00000494926 544 ntTSL 514.86□□□□□ -0.038e-7■■■■■ 41
FMR1Q06787 TM2D1-205ENST00000468586 637 ntTSL 39.76□□□□□ -0.858e-7■■■■■ 41
FMR1Q06787 TM2D1-207ENST00000472989 531 ntTSL 36.31□□□□□ -1.48e-7■■■■■ 41
FMR1Q06787 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 41
FMR1Q06787 MAP2K5-209ENST00000558392 1506 ntTSL 523.88■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 41
FMR1Q06787 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 41
FMR1Q06787 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 41
FMR1Q06787 MAP2K5-205ENST00000439036 429 ntTSL 37.5□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 41
FMR1Q06787 MAP2K5-212ENST00000560591 1457 ntTSL 37.35□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 41
FMR1Q06787 MAP2K5-210ENST00000559262 814 ntTSL 57.33□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 41
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 86.6 ms