Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
OCA2Q04671 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OCA2Q04671 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OCA2Q04671 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OCA2Q04671 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms