Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
ERCC6Q03468 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
ERCC6Q03468 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
ERCC6Q03468 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC44.47■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
ERCC6Q03468 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
ERCC6Q03468 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC44.37■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
ERCC6Q03468 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC44.28■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms