Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAV1Q03135 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAV1Q03135 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAV1Q03135 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAV1Q03135 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.7 ms