Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BDH1Q02338 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDH1Q02338 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BDH1Q02338 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BDH1Q02338 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms