Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPCAP84074 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPCAP84074 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HPCAP84074 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPCAP84074 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPCAP84074 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPCAP84074 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HPCAP84074 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPCAP84074 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPCAP84074 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPCAP84074 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPCAP84074 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPCAP84074 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HPCAP84074 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPCAP84074 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPCAP84074 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPCAP84074 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HPCAP84074 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPCAP84074 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPCAP84074 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPCAP84074 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPCAP84074 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPCAP84074 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HPCAP84074 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPCAP84074 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPCAP84074 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPCAP84074 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPCAP84074 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPCAP84074 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HPCAP84074 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPCAP84074 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPCAP84074 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPCAP84074 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HPCAP84074 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HPCAP84074 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPCAP84074 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPCAP84074 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPCAP84074 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPCAP84074 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HPCAP84074 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPCAP84074 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPCAP84074 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPCAP84074 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPCAP84074 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HPCAP84074 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPCAP84074 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPCAP84074 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPCAP84074 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPCAP84074 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HPCAP84074 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HPCAP84074 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPCAP84074 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPCAP84074 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HPCAP84074 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HPCAP84074 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HPCAP84074 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPCAP84074 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPCAP84074 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPCAP84074 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPCAP84074 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HPCAP84074 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPCAP84074 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPCAP84074 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPCAP84074 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HPCAP84074 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPCAP84074 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPCAP84074 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPCAP84074 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPCAP84074 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPCAP84074 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPCAP84074 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HPCAP84074 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPCAP84074 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HPCAP84074 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPCAP84074 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPCAP84074 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPCAP84074 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPCAP84074 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HPCAP84074 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPCAP84074 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPCAP84074 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HPCAP84074 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPCAP84074 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HPCAP84074 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPCAP84074 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HPCAP84074 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPCAP84074 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPCAP84074 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HPCAP84074 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HPCAP84074 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPCAP84074 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPCAP84074 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HPCAP84074 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPCAP84074 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPCAP84074 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPCAP84074 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPCAP84074 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPCAP84074 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HPCAP84074 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPCAP84074 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms