Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFAP3P55082 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MFAP3P55082 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MFAP3P55082 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MFAP3P55082 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MFAP3P55082 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MFAP3P55082 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MFAP3P55082 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms