Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRISP1P54107 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRISP1P54107 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRISP1P54107 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRISP1P54107 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRISP1P54107 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms