Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMTNP53814 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMTNP53814 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMTNP53814 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMTNP53814 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMTNP53814 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMTNP53814 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMTNP53814 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMTNP53814 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMTNP53814 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMTNP53814 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMTNP53814 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMTNP53814 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMTNP53814 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMTNP53814 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMTNP53814 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMTNP53814 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMTNP53814 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMTNP53814 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMTNP53814 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMTNP53814 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMTNP53814 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNP53814 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNP53814 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNP53814 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMTNP53814 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMTNP53814 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMTNP53814 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMTNP53814 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMTNP53814 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SMTNP53814 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMTNP53814 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMTNP53814 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMTNP53814 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMTNP53814 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMTNP53814 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMTNP53814 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMTNP53814 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMTNP53814 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNP53814 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNP53814 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNP53814 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNP53814 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNP53814 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMTNP53814 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMTNP53814 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMTNP53814 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMTNP53814 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMTNP53814 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMTNP53814 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMTNP53814 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMTNP53814 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMTNP53814 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMTNP53814 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMTNP53814 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMTNP53814 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMTNP53814 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMTNP53814 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMTNP53814 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMTNP53814 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMTNP53814 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMTNP53814 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMTNP53814 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMTNP53814 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMTNP53814 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMTNP53814 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMTNP53814 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMTNP53814 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMTNP53814 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMTNP53814 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMTNP53814 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMTNP53814 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMTNP53814 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMTNP53814 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMTNP53814 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMTNP53814 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMTNP53814 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMTNP53814 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMTNP53814 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMTNP53814 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMTNP53814 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMTNP53814 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMTNP53814 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMTNP53814 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMTNP53814 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMTNP53814 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMTNP53814 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMTNP53814 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMTNP53814 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMTNP53814 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMTNP53814 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMTNP53814 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMTNP53814 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMTNP53814 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMTNP53814 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMTNP53814 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMTNP53814 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMTNP53814 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMTNP53814 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMTNP53814 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms