Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VEGFBP49765 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
VEGFBP49765 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VEGFBP49765 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
VEGFBP49765 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
VEGFBP49765 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms